在游戏中心打工的青年草壁莲司，偶然目睹了一幕：情人节当天，一位英国少女莉莉独自一人沉迷于抓娃娃机。无论尝试多少次，她始终无法抓到奖品，眼看着要落泪的她，让莲司忍不住伸出援手。在成功抓到娃娃后，莉莉

讲述了忍者神龟与蝙蝠侠跨时空相遇，他们本都是默默守护正义的使者。然而在铲除罪恶的过程中蝙蝠侠和忍者神龟产生了误解，经过一系列打斗后，解除彼此的误解，共同作战，守护城市的和平以及人们的安全。